Doktorand i medicinsk vetenskap: polymikrobiell urinvägsinfektionsmodell

Lunds universitet grundades 1666 och rankas återkommande som ett av världens främsta lärosäten. Här finns omkring 46 000 studenter och 8 500 medarbetare i Lund, Helsingborg och Malmö. Vi förenas i vår strävan att förstå, förklara och förbättra vår värld och människors villkor.

Beskrivning av verksamheten

Tjänsten är placerad vid laboratoriet Microbial Evolutionary Genetics (MEG), som leds av Johannes Cairns vid Institutionen för experimentell medicinsk vetenskap, Medicinska fakulteten, Lunds universitet.

Forskargruppen studerar mikrobiell evolution, antibiotikaresistens och mikrobiella interaktioner med hjälp av experimentell evolution, mikrobiell ekologi, bioinformatik och kvantitativ analys. Gruppen kombinerar experimentell mikrobiologi med dataanalys och samarbetar med nationella och internationella forskningsmiljöer.

Doktoranden kommer att arbeta vid BMC i Lund i en liten tvärvetenskaplig forskningsmiljö med nära handledning och samarbete mellan experimentella och beräkningsinriktade forskare.

Forskargruppens webbplats: https://johannescairns.github.io/meg-lab/.

Projektbeskrivning

Doktorandprojektet "Predicting eco-evolutionary dynamics in a polymicrobial urinary tract infection model" undersöker hur artinteraktioner påverkar antibiotikarespons, samhällssammansättning, biofilmsbildning och resistensutveckling i en definierad femartsmodell för urinvägsinfektioner. Projektet kombinerar longitudinella experiment i planktoniska och biofilmsystem med kvantitativ analys. Arbetet omfattar experimentell evolution, bakterieodling och fenotypning, antibiotika-dos-respons, sekvenseringsbaserad analys av samhällssammansättning samt statistisk modellering och bioinformatik. Projektet ingår i DDLS-miljön och genomförs i samarbete med forskare vid Lunds universitet och andra universitet.

Huvudarbetsuppgifterna för en doktorand är att ägna sig åt sin forskarutbildning och därför kommer du både vara antagen som student och anställd vid Lunds universitet.

Du kommer att:Planera och genomföra longitudinella experiment med definierade polymikrobiella UVI-modellsystemEtablera, underhålla och kvalitetssäkra mikrobiella odlingssystem, inklusive planktoniska och biofilmbaserade modellerGenomföra bakterieodling, provtagning, tillväxtkvantifiering, antibiotika-dos-respons och resistensfenotypningSätta dig in i och använda universitetets system för kemikaliehantering, riskbedömning och elektronisk laboratoriedokumentationArbeta i ett BSL-2-laboratorium och följa gällande biosäkerhetsrutiner, riskbedömningar och lokala säkerhetsföreskrifterAnalysera experimentella data i R och/eller Python och bidra till statistisk modellering och visualiseringAnalysera sekvenseringsbaserade och, efter behov, andra omikdataDelta i experimentell planering, datahantering, manusförfattande, seminarier och vetenskapliga konferenserGenomföra obligatoriska kurser och andra moment inom forskarutbildningenKvalifikationer

Krav för antagningen är:Avlagd examen på avancerad nivå, fullgjorda kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller på något annat sätt inom eller utom landet förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaperGod förmåga av att tillgodogöra sig forskarutbildningenMinst 60 högskolepoäng inom ett ämnesområde relevant för medicinsk vetenskapKrav för anställningen är:Du har en masterexamen inom mikrobiologi, molekylärbiologi, bioteknik eller annat område relevant för projektetDu har dokumenterad praktisk erfarenhet av experimentellt mikrobiologiskt laboratoriearbete, inklusive bakterieodling, aseptisk teknik och kvantifiering av mikrobiell tillväxtDu har erfarenhet av att etablera och underhålla definierade mikrobiella odlingssystem och arbeta med syntetiska eller polymikrobiella bakteriesamhällenDu har dokumenterad erfarenhet av in vitro-modeller för polymikrobiella urinvägsinfektioner eller ett nära jämförbart infektionsrelevant polymikrobiellt modellsystemDu har erfarenhet av experiment som undersöker antibiotikarespons, mikrobiella interaktioner eller evolutionära förändringar i bakteriesamhällenDu har grundläggande erfarenhet av datahantering och analys i R och/eller PythonDu har mycket goda kunskaper i engelska i tal och skriftDu är självgående och uthållig, har god skriftlig förmåga och kan arbeta strukturerat både självständigt och i samarbete med andraMeriterande för anställningen är:Du har erfarenhet av biofilmsystem, kateterrelaterade modeller eller andra infektionsrelevanta biofilmsystemDu har erfarenhet av experimentell evolution och/eller forskning om antimikrobiell resistensDu har erfarenhet av statistisk modellering, bioinformatik eller analys av sekvenseringsbaserade mikrobiella dataDu har erfarenhet av arbete i forskningslaboratorium eller kliniskt mikrobiologiskt laboratoriumDu har erfarenhet av kvantitativ mikrobiell fenotypning, exempelvis flödescytometriStor vikt kommer att läggas vid hur den sökande genom sin erfarenhet och kompetens bedöms ha den förmåga som behövs för att klara forskarutbildningen.

Lunds universitet är en statlig myndighet vilket innebär att du får särskilda förmåner, generös semester och en förmånlig tjänstepension. Som doktorand vid Lunds universitet är du både antagen som student och anställd vilket ger flera förmåner. Läs mer om att vara antagen och anställd vid på universitetets webbplats.

Som doktorand i MEG Lab får du tillgång till modern mikrobiologisk laboratorieinfrastruktur vid BMC, nära handledning och deltagande i DDLS-nätverkets utbildningar och vetenskapliga möten. Projektet ger träning i både experimentell mikrobiologi och kvantitativ dataanalys samt möjlighet till samarbete med nationella och internationella forskare.

Läs mer på universitetets webbplats om att vara anställd hos oss Jobba hos oss.

Om anställningen

Anställningen är en visstidsanställning på sammanlagt fyra år, 100 %, med preliminärt startdatum 2026-11-16 eller enligt överenskommelse. Huvudregeln är att anställningar vid Lunds universitet bedrivs i Sverige och arbetet ska huvudsakligen utföras på plats vid BMC i Lund.

Bestämmelser gällande anställning som doktorand finns i Högskoleförordningen (1993:100), 5 kap 1-7 §§. Bestämmelser gällande antagning till forskarstudier finns i 6 kap. 3 § högskoleförordningen (1993:100). Mer information finns på universitetets hemsida.

Övrigt

För doktorander finns en särskild lönestege knuten till varje fakultet och lön sätts enligt aktuell lönestege.

Intervjuer kan genomföras på plats i Lund eller digitalt.

Så här söker du

Anställningen söks via universitetets rekryteringssystem. Ansökan ska innehålla personligt brev med motivering till varför du är intresserad av anställningen och på vilket sätt anställningen matchar dina meriter, CV, examensbevis och betygsutdrag samt masteruppsats eller motsvarande självständigt arbete.

Mer information om Medicinska fakulteten

Medicinska fakulteten är ett verksamhetsområde inom Lunds universitet, med ansvar för utbildning och forskning inom medicin, vård och hälsa. Utbildningen sker i nära samverkan med sjukvården och är väl förankrad i fakultetens starka forskningstradition. Fakultetens forskning spänner över ett brett fält inom experimentell grundforskning, patientnära klinisk forskning och hälsovetenskaplig forskning. Medicinska fakulteten, med drygt 1800 anställda och 3000 studenter i Lund, Malmö och Helsingborg, är en kunskapsintensiv mötesplats för studenter, lärare och forskare från hela världen.

Vi undanber oss alla kontakter från annonsförsäljare, rekryterings- och bemanningsföretag på grund av statliga upphandlingsregler.